Arc研究所通过行业合作扩展虚拟细胞图谱

2025-04-29 08:56:44
来源:News-Medical.Net
语言:英语,所在国:美国
分类:细胞生物学、基因组学,字数:1212

Arc研究所继续致力于生成和共享大规模高质量的细胞状态数据集,这些数据集包括在化学或遗传扰动前后的细胞状态,以支持“虚拟细胞”模型及其他创新。自推出包含超过3亿个细胞的Arc虚拟细胞图谱两个月后,该计划现在受益于与10x Genomics和Ultima Genomics的新合作,这两家公司是先进工具领域的领导者,使科学家能够更快、更可扩展且更经济地收集单细胞数据,从而改善人类健康。

“通过结合Arc的专业知识以及10x和Ultima的尖端技术,我们将能够在更大规模上生成高质量的扰动单细胞数据。”Arc执行董事、联合创始人兼核心研究员Silvana Konermann表示,“我们很高兴能够向科学界提供这一资源,使这些数据集能够为最准确的模型提供信息。”

利用10x的高分辨率单细胞分析平台,特别是其Chromium Flex技术,Arc研究人员将能够以前所未有的规模和质量生成扰动数据。这项技术使得可以同时以最低的每细胞成本和最高分辨率检查数百万个被扰动的单个细胞。

“GEM-X Flex是为了应对当今最具雄心的生物学问题而设计的——以可行的成本提供大规模高质量的单细胞数据。”10x Genomics首席执行官Serge Saxonov表示,“我们很兴奋能够促进生物领域越来越强大的AI模型的创建,加速科学发现并改变药物开发。”

Arc将利用Ultima的UG 100测序系统及其最近推出的Solaris化学方法来扩大下一阶段的数据生成和图谱扩展。Ultima独特的基于晶圆的测序架构和新型化学方法将使Arc研究人员能够以比其他方法更低的成本生成更多的数据。UG 100平台已被Arc验证,当与10x的GEM-X Flex结合使用时,能够无缝运行,并在大规模下生成高质量数据。此外,Arc研究人员还将获得并使用UG 100 Solaris Boost,这是一种目前处于早期访问阶段的新高通量操作模式,以进一步增加数据输出。

“我们的独特测序技术旨在超越传统方法,降低基因组信息的成本,并实现大规模数据生成。”Ultima Genomics创始人兼首席执行官Gilad Almogy表示,“新兴的AI/ML应用,如大规模扰动数据集和虚拟细胞图谱,突显了我们技术和低成本测序的优势。我们很荣幸能与Arc和10x Genomics合作,推进这些资源的开发,以加速科学发现并加深对生物学复杂性的理解。”

Arc正在通过与其他合作伙伴和研究工作的额外合作,继续构建图谱,引入更多的单细胞数据。目标是为机器学习工作提供长期资源,以转变生物学。

“在Arc,我们正在开发工具,可以预测哪些扰动能够有效地将患病细胞恢复到健康状态。与其采用当前实验生物医学中普遍存在的试错法,一个预测性的‘世界模型’可以帮助我们集中精力于最有希望的治疗靶点。”

Arc联合创始人兼核心研究员Patrick Hsu


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